MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 34240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	ATT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904397
2	NC_009975	GT	3	6	934	939	0 %	50 %	50 %	0 %	159904397
3	NC_009975	AATG	2	8	995	1002	50 %	25 %	25 %	0 %	159904397
4	NC_009975	T	6	6	1053	1058	0 %	100 %	0 %	0 %	159904397
5	NC_009975	ACC	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159904397
6	NC_009975	ATT	2	6	1107	1112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904397
7	NC_009975	TGG	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159904397
8	NC_009975	T	7	7	1172	1178	0 %	100 %	0 %	0 %	159904398
9	NC_009975	GTA	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904398
10	NC_009975	AAT	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904398
11	NC_009975	ACT	2	6	1285	1290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904398
12	NC_009975	TAG	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904398
13	NC_009975	TAC	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904398
14	NC_009975	TAG	2	6	1346	1351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904398
15	NC_009975	ATA	3	9	1358	1366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904398
16	NC_009975	TTAT	2	8	1367	1374	25 %	75 %	0 %	0 %	159904398
17	NC_009975	TTC	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904398
18	NC_009975	TTA	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904398
19	NC_009975	ATT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904398
20	NC_009975	AAT	2	6	1633	1638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904398
21	NC_009975	TAT	2	6	1651	1656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904398
22	NC_009975	T	6	6	1684	1689	0 %	100 %	0 %	0 %	159904398
23	NC_009975	CAA	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904398
24	NC_009975	CTT	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904398
25	NC_009975	TTC	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904398
26	NC_009975	TCT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904398
27	NC_009975	TGG	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159904398
28	NC_009975	AT	3	6	1876	1881	50 %	50 %	0 %	0 %	159904398
29	NC_009975	TGG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159904398
30	NC_009975	TAACTG	2	12	2024	2035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904398
31	NC_009975	ACA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904398
32	NC_009975	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904398
33	NC_009975	TAT	2	6	2218	2223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904398
34	NC_009975	AGC	2	6	2244	2249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904398
35	NC_009975	ATT	2	6	2660	2665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904398
36	NC_009975	TGA	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904398
37	NC_009975	ACAGT	2	10	2734	2743	40 %	20 %	20 %	20 %	159904398
38	NC_009975	GTT	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904398
39	NC_009975	AT	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	159904398
40	NC_009975	GCT	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904398
41	NC_009975	GCA	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904398
42	NC_009975	A	6	6	3091	3096	100 %	0 %	0 %	0 %	159904398
43	NC_009975	T	7	7	3130	3136	0 %	100 %	0 %	0 %	159904399
44	NC_009975	GGATG	2	10	3195	3204	20 %	20 %	60 %	0 %	159904399
45	NC_009975	TGC	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904399
46	NC_009975	TGCAGT	2	12	3242	3253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159904399
47	NC_009975	TTG	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904399
48	NC_009975	GGAATT	2	12	3285	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
49	NC_009975	AGA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
50	NC_009975	GCA	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904399
51	NC_009975	TGA	2	6	3395	3400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
52	NC_009975	GAA	2	6	3429	3434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
53	NC_009975	AGA	2	6	3458	3463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
54	NC_009975	GCA	2	6	3468	3473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904399
55	NC_009975	AT	3	6	3585	3590	50 %	50 %	0 %	0 %	159904399
56	NC_009975	TGA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
57	NC_009975	GAT	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
58	NC_009975	AAG	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
59	NC_009975	GAA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
60	NC_009975	TTC	2	6	3868	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904399
61	NC_009975	TTG	3	9	3910	3918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904399
62	NC_009975	AGA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
63	NC_009975	GAA	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
64	NC_009975	ACC	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159904399
65	NC_009975	TAT	2	6	4083	4088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904399
66	NC_009975	TCCC	2	8	4107	4114	0 %	25 %	0 %	75 %	159904399
67	NC_009975	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904399
68	NC_009975	ATT	2	6	4182	4187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904399
69	NC_009975	TCA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904399
70	NC_009975	TTG	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904399
71	NC_009975	GAT	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
72	NC_009975	GAT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
73	NC_009975	CAA	2	6	4342	4347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904399
74	NC_009975	GAT	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
75	NC_009975	GAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
76	NC_009975	AGA	2	6	4574	4579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
77	NC_009975	AGA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
78	NC_009975	GAT	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
79	NC_009975	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904399
80	NC_009975	GA	3	6	4871	4876	50 %	0 %	50 %	0 %	159904399
81	NC_009975	TGA	2	6	4904	4909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
82	NC_009975	TGG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159904399
83	NC_009975	ATT	2	6	5067	5072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904399
84	NC_009975	GCA	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904399
85	NC_009975	TAT	2	6	5119	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904399
86	NC_009975	T	6	6	5151	5156	0 %	100 %	0 %	0 %	159904400
87	NC_009975	AAT	2	6	5269	5274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904400
88	NC_009975	TGT	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904400
89	NC_009975	GCA	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904400
90	NC_009975	AC	3	6	5381	5386	50 %	0 %	0 %	50 %	159904400
91	NC_009975	CT	3	6	5462	5467	0 %	50 %	0 %	50 %	159904400
92	NC_009975	CAG	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904400
93	NC_009975	TATT	2	8	5548	5555	25 %	75 %	0 %	0 %	159904400
94	NC_009975	GAAAA	2	10	5570	5579	80 %	0 %	20 %	0 %	159904400
95	NC_009975	TACTT	2	10	5585	5594	20 %	60 %	0 %	20 %	159904400
96	NC_009975	CAA	2	6	5606	5611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904400
97	NC_009975	TTAT	2	8	5628	5635	25 %	75 %	0 %	0 %	159904400
98	NC_009975	AAT	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904400
99	NC_009975	TCT	2	6	5795	5800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904401
100	NC_009975	ATGG	2	8	5804	5811	25 %	25 %	50 %	0 %	159904401
101	NC_009975	CTT	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904401
102	NC_009975	TCTT	2	8	5941	5948	0 %	75 %	0 %	25 %	159904401
103	NC_009975	A	6	6	6006	6011	100 %	0 %	0 %	0 %	159904401
104	NC_009975	TTG	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904402
105	NC_009975	GAT	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904402
106	NC_009975	ATT	2	6	6475	6480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904402
107	NC_009975	AAC	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904402
108	NC_009975	GCA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904402
109	NC_009975	CTG	2	6	6671	6676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904402
110	NC_009975	GAA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904402
111	NC_009975	TAC	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904402
112	NC_009975	GTT	2	6	6709	6714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904402
113	NC_009975	GAA	2	6	6796	6801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904402
114	NC_009975	ACA	2	6	6887	6892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904402
115	NC_009975	CTG	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904402
116	NC_009975	ACA	2	6	6931	6936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904402
117	NC_009975	TAT	3	9	7018	7026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904402
118	NC_009975	TGA	2	6	7041	7046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904402
119	NC_009975	CTG	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904402
120	NC_009975	TGC	2	6	7098	7103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904402
121	NC_009975	TGG	2	6	7194	7199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159904403
122	NC_009975	TTC	2	6	7244	7249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159904403
123	NC_009975	ACA	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904403
124	NC_009975	ACA	2	6	7338	7343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904403
125	NC_009975	ACC	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159904403
126	NC_009975	GTT	2	6	7362	7367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904403
127	NC_009975	GCA	2	6	7440	7445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159904403
128	NC_009975	TGC	2	6	7457	7462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159904403
129	NC_009975	TA	3	6	7477	7482	50 %	50 %	0 %	0 %	159904403
130	NC_009975	GAT	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904403
131	NC_009975	ATT	2	6	7511	7516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159904403
132	NC_009975	GCTTG	2	10	7524	7533	0 %	40 %	40 %	20 %	159904403
133	NC_009975	GAA	2	6	7609	7614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904404
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